1、流動相使用前必須經脫氣和過濾處理。

    2、更換色譜柱前，須對使用的色譜柱進行沖洗(如應用的流動相含有酸或無機鹽，應當用20倍柱體積純凈水沖洗干凈)、平衡后，保存在有機溶劑中(乙腈或甲醇較好)。

    3、取下色譜柱時，應立即將兩端接頭封口。除情況外，一般都應使用預保護柱。

    4、測試完畢后，切忌直接用純有機溶劑沖洗柱子，須用90%水-10%有機溶劑沖洗至少40min后，再用有機溶劑沖洗30min左右，后將色譜柱保存在有機溶劑中。

    5、避免流動相組成及性的劇烈變化。當流動相中含有緩沖溶液，不要直接切換到溶劑，應該用無緩沖流動相沖洗20～30min后，再更換溶劑，更換流動相時，流速應不過0.5ml/min。如果突然切換到濃度有機溶劑，可能會使HPLC流動體系中的緩沖液沉淀，這樣會導致更大的問題如柱頭堵塞、管道堵塞、活塞損傷或進樣閥轉軸失靈。

    液相色譜法只要求樣品能制成溶液，不受樣品揮發性的限制，流動相可選擇的范圍寬，固定相的種類繁多，因而可以分離熱不穩定和非揮發性的、離解的和非離解的以及各種分子量范圍的物質。與試樣預處理技術相配合，HPLC所達到的分辨率和靈敏度，使分離和同時測定性質上十分相近的物質成為可能，能夠分離復雜相體中的微量成分。隨著固定相的發展，有可能在充分保持生化物質活性的條件下完成其分離。HPLC成為解決生化分析問題有前途的方法。由于HPLC具有分辨率、靈敏度、速度快、色譜柱可反復利用，流出組分易收集等點，因而被應用到生物化學、食品分析、醫藥研究、環境分析、無機分析等各種領域。液相色譜儀與結構儀器的聯用是一個重要的發展方向。液相色譜- 質譜連用技術受到普遍重視，如分析氨基甲酸酯農藥和多核芳烴等；液相色譜- 紅外光譜聯用也發展快，如在環境污染分析測定水中的烴類，海水中的不揮發烴類，使環境污染分析得到的發展。